Gosemsim.

DOI:10.18129 / b9.bioc.gosemsim

Go-术语语义相似措施

Bioconductor版本:释放(3.13)

基因本体学(GO)注释的语义比较提供了计算基因和基因组之间的相似性的定量方法,并且已经成为许多生物信息学分析方法的重要依据。Gosemsim是GO条款,GO术语,基因产品和基因集群的语义相似性计算的R包。GoSemsim分别实施了Vernik,Schlicker,Jiang,Lin和Wang提出的五种方法。

作者:广东余[AUT,CRE],Alexey Stukalov [CTB],Chuanle Xiao [CTB],Lluísrevilla sancho [CTB]

维护者:广东宇<广东峪在Gmail.com>

引文(从R内,输入引文(“gosemsim”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percenaMeSpace(“BiocManager”,静静= True))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“gosemsim”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“Gosemsim”)

HTML. r script. Gosemsim.
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 2.18.0
在生物导体中以来 BIOC 2.4(R-2.9)(12年)
执照 艺术-2.0
依靠 r(> = 3.5.0)
进口 annotationdbi.go.db.,方法,utils
链接到 rcpp.
建议 annotationhub.Biocmanager.ClusterProfiler.剂量knRAMAMAMDOW.org.hs.eg.db.prettydoc.testthat.
系统要求
加强
URL. https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book//book//
Bugreports. https://github.com/yulab-smu/gosemsims.
取决于我 翻译
进口我 ClusterProfiler.剂量纪念碑Gapgom.网格RCPI.RRVGO.simplifyencrice.毕验法
建议我 生物主学epinem.小伙子讽刺
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 gosemsim_2.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件 gosemsim_2.18.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) gosemsim_2.18.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/gosemsim
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包装/ gosemsim
包短网址 https://biocumon.org/packages/gosemsim/
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