Bioconductor版本:释放(3.13)
基因本体学(GO)注释的语义比较提供了计算基因和基因组之间的相似性的定量方法,并且已经成为许多生物信息学分析方法的重要依据。Gosemsim是GO条款,GO术语,基因产品和基因集群的语义相似性计算的R包。GoSemsim分别实施了Vernik,Schlicker,Jiang,Lin和Wang提出的五种方法。
作者:广东余[AUT,CRE],Alexey Stukalov [CTB],Chuanle Xiao [CTB],Lluísrevilla sancho [CTB]
维护者:广东宇<广东峪在Gmail.com>
引文(从R内,输入引文(“gosemsim”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percenaMeSpace(“BiocManager”,静静= True))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“gosemsim”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
Browsevignettes(“Gosemsim”)
HTML. | r script. | Gosemsim. |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 2.18.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.4(R-2.9)(12年) |
执照 | 艺术-2.0 |
依靠 | r(> = 3.5.0) |
进口 | annotationdbi.那go.db.,方法,utils |
链接到 | rcpp. |
建议 | annotationhub.那Biocmanager.那ClusterProfiler.那剂量那kn那RAMAMAMDOW.那org.hs.eg.db.那prettydoc.那testthat. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book//book// |
Bugreports. | https://github.com/yulab-smu/gosemsims. |
取决于我 | 翻译 |
进口我 | ClusterProfiler.那剂量那纪念碑那Gapgom.那网格那RCPI.那RRVGO.那simplifyencrice.那毕验法 |
建议我 | 生物主学那epinem.那小伙子那讽刺 |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | gosemsim_2.18.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | gosemsim_2.18.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | gosemsim_2.18.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/gosemsim |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包装/ gosemsim |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/gosemsim/ |
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