哥特

doi：10.18129/b9.bioc.gothic

HI-C数据分析的二项式测试

生物导体版本：版本（3.13）

这是使用累积二项式测试的HI-C分析软件包，以检测远端基因组基因座之间的相互作用，这些远端基因组基因群的读取明显超过HI-C实验中的偶然性。它采用映射的配对NG读为输入，并回馈基因组中给定垃圾箱大小的显着相互作用的列表。

作者：Borbala Mifsud和Robert Sugar

维护者：borbala mifsud

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ gothic”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“哥特式”）

PDF	R脚本	package_vignettes.pdf
PDF		参考手册

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.28.0
在生物导体中	Bioc 2.14（R-3.1）（7年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 3.5.0），方法，基因组机，，，，生物弦，，，，BSGENOME，，，，Data.Table
进口	生物基因，，，，S4VECTORS（> = 0.9.38），iranges，，，，rsamtools，，，，Shortread，，，，rtracklayer，，，，GGPLOT2，，，，生物管理器，grdevices，utils，stats，GenomeInfodB
链接
建议	Hicdatalymphoblast
系统要求
增强	平行
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Gothic_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	gothic_1.28.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Gothic_1.28.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gothic
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/哥特式
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/gothic/
软件包下载报告	下载统计