GOstats

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOstats

用于操作GO和微阵列的工具

生物导体版本:发布(3.12)

一套与GO和微阵列数据交互的工具。各种基本的图形操作工具，假设检验和其他简单的计算。

作者:Robert Gentleman [aut]， Seth Falcon [ctb]， Robert Castelo [ctb]， Bioconductor Package Maintainer [cre]

Maintainer: Bioconductor Package Maintainer < Maintainer at Bioconductor。org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("GOstats")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GOstats”)

PDF	R脚本	对不常见的模式生物的超几何测试
PDF	R脚本	使用GOstats的超几何测试
PDF	R脚本	使用GOstats可视化数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	2.56.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 15.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.10),Biobase(> = 1.15.29),类别(> = 2.43.2),图
进口	方法、统计stats4,AnnotationDbi(> = 0.0.89),GO.db(> = 1.13.0),RBGL,注释(> = 1.13.2),AnnotationForge,Rgraphviz
链接
建议	hgu95av2.db(> = 1.13.0),所有,乘,genefilter,RColorBrewer,xtable,SparseM,GSEABase,geneplotter,org.Hs.eg.db,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	MineICA,PloGO2,RDAVIDWebService
进口我	affycoretools,吸引,categoryCompare,GmicR,理想的,MIGSA,miRLAB,pcaExplorer,ReportingTools,scTensor,systemPipeR
建议我	a4,BiocCaseStudies,类别,eisa,fastLiquidAssociation,GSEAlm,interactiveDisplay,MineICA,中长期规划,MmPalateMiRNA,qpgraph,RnBeads,安全
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GOstats_2.56.0.tar.gz
Windows二进制	GOstats_2.56.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GOstats_2.56.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOstats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GOstats
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GOstats/
包下载报告	下载数据