GUIDESEQ.

DOI：10.18129 / b9.bioc.guideSQ.

指南SEQ分析管道

Bioconductor版本：释放（3.13）

包装实现指南-SEQ分析工作流程，包括获取唯一插入站点（切割位点的代理）的功能，估计插入位点，AKA，峰值，从加号和减号的估计插入位点，并执行目标搜索插入位点周围的延伸区域。

作者：Lihua Julie Buu，Michael Lawrence，Ankit Gupta，HervéPagès，Alper Kucukalural，Manuel Garber，Scot A. Wolfe

维护者：Lihua Julie Zhu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percenameSpace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“guideSeq”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“GUIDESEQ”）

PDF.	r script.	GuideASQ Vignette.
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.22.0
在生物导体中以来	BIOC 3.2（R-3.2）（5.5岁）
执照	GPL（> = 2）
依靠	r（> = 3.2.0），Genomicranges.那生物根系
进口	生物相投那生物仪器那Crispseek.那Chippeakanno.那data.table.那MatrixStats.那bsgenome.， 平行，绞喉（> = 2.5.5），S4Vectors.（> = 0.9.6），基因管理（> = 1.7.3），Genomeinfodb.那RSAMTOOLS.那哈希那林马那dplyr.
链接到
建议	kn那运行那生物焦那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那org.hs.eg.db.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我	Crisprseekplus.
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	guideSeq_1.22.0.tar.gz.
Windows二进制文件	guideSeQ_1.22.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	GuideSeq_1.22.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/guideSQ.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ GuideSeq
包短网址	https://biocumon.org/packages/guideSeq/
包裹下载报告	下载统计信息