格纳

doi:10.18129/b9.bioc.gwena

用于增强共表达分析的管道

生物导体版本:版本(3.15)

高通量测序的开发导致对共表达分析的使用增加了碧昂的单一特征(即基因)焦点。我们提出了GWENA(基因全共表达网络分析),该工具旨在执行基因共表达网络分析并探索单个管道中的结果。它包括共表达基因模块,表型关联,拓扑分析和条件之间网络配置的比较的功能丰富。

作者:GwenaëlleLemoine[AUT,CRE],玛丽·皮埃(Marie-Pier)Scott-Boyer [Ths],Arnaud Droit [fnd]

维护者:Gmail.com上的GwenaëlleLemoine

引用(从r内,输入引用(“ Gwena”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gwena”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Gwena”)

html R脚本 Gwena-Vignette
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细节

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版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 4.1)
进口 WGCNA(> = 1.67),dplyr(> = 0.8.3),DynamiCtreCut(> = 1.63-1),GGPLOT2(> = 3.1.1),Gprofiler2(> = 0.1.6),马格里特(> = 1.5),蒂布尔(> = 2.1.1),花花公子(> = 1.0.0),Netrep(> = 1.2.1),Igraph(> = 1.2.4.1),rcolorbrewer(> = 1.1-2),purrr(> = 0.3.3),rlist(> = 0.4.6.1),矩阵(> = 0.55.0),总结性特征(> = 1.14.1),Stringr(> = 1.4.0),(> = 2.1.0),grdevices(> = 4.0.4),方法,图形,统计,utils
链接
建议 测试(> = 2.1.0),尼特(> = 1.25),rmarkDown(> = 1.16),Prettydoc(> = 0.3.0),httr(> = 1.4.1),S4VECTORS(> = 0.22.1),生物使用(> = 2.15.8)
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/kumquatum/gwena/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gwena_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 gwena_1.6.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) gwena_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwena
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/gwena
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/gwena/
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