Genvisr.

DOI：10.18129 / b9.bioc.genvisr.

r的基因组可视化

Bioconductor版本：释放（3.13）

主要在队列级别为基因组数据产生高度可定制的出版质量图形。

作者：Zachary Skidmore [Aut，Cre]，Alex Wagner [Aut]，Robert Lesurf [Aut]，Katie Campbell [Aut]，Jason Kunisaki [Aut]，Obi Griffith [AUT]，Malachi Griffith [Aut]

维护者：zachary skidmore

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“genvisr”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“GENVISR”）

HTML.	r script.	Genvisr：介绍
HTML.	r script.	可视化小变种
HTML.	r script.	瀑布：功能介绍
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文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.24.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（5年）
执照	gpl-3 +文件执照
依靠	R（> = 3.3.0），方法
进口	annotationdbi.那生物雕（> = 2.45.8），生物根系那生物仪器那DBI.那FFIET.那基因组法那Genomicranges.（> = 1.25.4），ggplot2.（> = 2.1.0），格拉底（> = 2.0.0），GTABLE.那GTOOLS.那绞喉（> = 2.7.5），普利尔（> = 1.8.3），重塑2.那RSAMTOOLS.那秤那viridis.那data.table.那bsgenome.那Genomeinfodb.那VariantAnnotation.
链接到
建议	生物焦那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19那kn那RMYSQL.那Roxygen2.那testthat.那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那RAMAMAMDOW.那VDIFFR.那格式化那txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38
系统要求
加强
URL.
Bugreports.	https://github.com/griffithlab/genvisr/sisues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	genvisr_1.24.0.tar.gz.
Windows二进制文件	genvisr_1.24.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	genvisr_1.24.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/genvisr.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ Genvisr
包短网址	https://biocumon.org/packages/genvisr/
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