geneexpressionsignation

doi:10.18129/b9.bioc.geneexpressionsignature

基于基因表达签名基于基于相似度度量

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包提供了基因表达签名及其与每个基因表达式的实现。基因表达信号表示为表达与生物学兴趣状态相关的基因列表。它的距离是使用基于Kolmogorov-Smirnov统计量的非参数,基于等级的模式匹配策略来定义的。基因表达特征及其距离可用于检测药物,疾病和感兴趣生物学状态的特征之间的相似性。

作者:Yang Cao [AUT,CRE],Fei Li [CTB],Lu Han [CTB]

维护者:yang cao

引用(从r内,输入引用(“ geneexpressionsignature”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ geneexpressionsignature”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ geneexpressionsignature”)

html R脚本 geneexpressionsignation
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.38.0
在生物导体中 Bioc 2.9(R-2.14)(9。5年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 4.0)
进口 生物酶,统计,方法
链接
建议 APCLUSTER,,,,地球,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用
系统要求
增强
URL https://github.com/yiluheihei/geneexpressionsignature
BugReports https://github.com/yiluheihei/geneexpressionsignature/issues/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 geneexpressionsignature_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 geneexpressionsignature_1.38.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) geneexpressionsignature_1.38.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geneexpressionsignature
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/geneexpressionsignature
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/geneexpressionsignature/
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