GenegeneInter

DOI:10.18129 / b9.bioc.genegeneinter

用于测试基因水平的基因基因相互作用的工具

Bioconductor版本:释放(3.13)

本次方案的目的是提出几种用于测试基因基因相互作用的方法,以便控制协会研究。这种测试可以通过聚集在SNP水平(SSI)或使用基因 - 基因多维方法(GGI)方法中进行SNP-SNP相互作用试验来完成。该软件包还提出了用于结果的图形显示的工具。

作者:Mathieu Emily [Aut,Cre],Nicolas Sounac [CTB],Florian Kroell [CTB],Magalie Houee-Bigot [Aut]

维护者:Mathieu Emily

引文(从R内,输入引文(“GenegeneInter”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“genegeneinter”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

Browsevignettes(“GenegeneInter”)

PDF. r script. Genegeneinter介绍
PDF. r script. 成对互动测试
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.18.0
在生物导体中以来 BIOC 3.4(R-3.3)(4.5岁)
执照 GPL(> = 2)
依靠 r(> = 4.0)
进口 Snpstats.mvtnorm.RSAMTOOLS.iGraph.Kernlab.原因绞喉Genomicranges.data.table.,grdevices,图形,统计数据,utils,方法
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源包 GenegeneInter_1.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件 GenegeneInter_1.18.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) GenegeneInter_1.18.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/genegeneinter
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ GenegeneInter
包短网址 https://biocumon.org/packages/genegeneInter/
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