GeneTonic

DOI:10.18129 / B9.bioc.GeneTonic

享受分析和整合差异表达分析和功能富集分析的结果

生物导体版本:发布(3.13)

这个软件包提供了一个Shiny应用程序，旨在在不同层次上结合现有的转录组数据和结果片段，以一种更容易产生深刻的观察和假设的方式——结合交互性和再现性的好处，例如，通过捕获实时会话期间突出显示的特性和基因集，并创建一个HTML报告作为文本、代码和输出并存的工件。

作者:Federico Marini， Annekathrin Ludt [aut]

维护者:Federico Marini

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("GeneTonic")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GeneTonic”)

超文本标记语言	R脚本	GeneTonic用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	AnnotationDbi，骨干，bs4Dash，circlize，色彩，colourpicker，ComplexHeatmap，dendextend，DESeq2，dplyr，DT，dynamicTreeCut，expm，ggforce，ggplot2，ggrepel，GO.db、图形、grDevices、网格、igraph，matrixStats、方法、情节，RColorBrewer，rintrojs，rlang，rmarkdown，S4Vectors，尺度，闪亮的，shinycssloaders，shinyWidgets统计数据,SummarizedExperiment，tidyr、工具、跑龙套冬青，visNetwork
链接
建议	knitr，BiocStyle，htmltools，clusterProfiler，巨噬细胞，org.Hs.eg.db，magrittr，testthat(> = 2.1.0的)
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/federicomarini/GeneTonic
BugReports	https://github.com/federicomarini/GeneTonic/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	GeneTonic_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	GeneTonic_1.4.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	GeneTonic_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GeneTonic
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GeneTonic
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GeneTonic/
包下载报告	下载数据