GenomicDataCommons

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenomicDataCommons

NIH / NCI基因组数据共享访问

Bioconductor版本:Release (3.15)

以编程方式访问NIH / NCI基因组数据共享RESTful服务。

作者:Martin Morgan [aut]， Sean Davis [aut, cre]， Marcel Ramos [ctb]

维护者:Sean Davis

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GenomicDataCommons”)

超文本标记语言	R脚本	介绍访问NCI基因组数据共享
超文本标记语言	R脚本	多年来的问题和答案
超文本标记语言	R脚本	体细胞突变数据
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文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.20.1
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.4.0)，magrittr
进口	统计数据,httr，xml2，jsonlite跑龙套,rlang，readr，GenomicRanges，IRanges，dplyr，rappdirs，宠物猫
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，DT，testthat，列表视图，ggplot2，GenomicAlignments，Rsamtools，BiocParallel，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene，VariantAnnotation，maftools，R.utils，data.table
SystemRequirements
增强了
URL	//www.andersvercelli.com/packages/GenomicDataCommonshttp://github.com/Bioconductor/GenomicDataCommons
BugReports	https://github.com/Bioconductor/GenomicDataCommons/issues/new
全靠我
进口我	GDCRNATools，TCGAutils
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	GenomicDataCommons_1.20.1.tar.gz
Windows二进制	GenomicDataCommons_1.20.1.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	GenomicDataCommons_1.20.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenomicDataCommons
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GenomicDataCommons
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GenomicDataCommons/
软件包下载报告	下载数据
BioC 3.15的旧源包	源存档