基因组夫妇

DOI：10.18129 / b9.bioc.genomicfiles.

按文件或范围分发计算

Biocometiond版本：释放（3.12）

此程序包为并行计算分发“按文件”或“按范围”并行计算提供基础架构。用户定义的映射器和减速器功能为数据组合和操作提供了额外的灵活性。

作者：Bioconductor Package维护者[AUT，CRE]，Valerie Obenchain [Aut]，Michael Love [Aut]，Lori Shepherd [Aut]，Martin Morgan [Aut]

维护者：Bioconductor Package维护者

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！perceneNameSpace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“genomicfiles”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“GenomicFiles”）

PDF.	r script.	基因组介绍
PDF.		参考手册
文本		消息
视频		从BAM文件读取 - 第2部分

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.26.0
在生物导体中以来	BIOC 2.14（R-3.1）（7年）
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 3.1.0），方法，生物根系（> = 0.11.2），MatrixGenerics.那Genomicranges.（> = 1.31.16），概括分析那生物相投（> = 1.1.0），RSAMTOOLS.（> = 1.17.29），rtracklayer.（> = 1.25.3）
进口	基因管理（> = 1.7.7），绞喉那S4Vectors.（> = 0.9.25），VariantAnnotation.（> = 1.27.9），Genomeinfodb.
链接到
建议	生物焦那运行那Genefilter.那Deepsnv.那Snpstats.那rnaseqdata.hnrnpc.bam.chr14.那生物仪器那homo.sapiens.
系统要求
加强
URL.
取决于我	erma.
进口我	CageFightr.那cont那德内捷德那gqtlbase.那gqtlstats.那ldblock.那Quasr.那rqc.那vcfarray.那yrimulti
建议我	tfutils.那txreginfra.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	genomicfiles_1.26.0.tar.gz.
Windows二进制文件	genomicfiles_1.26.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	genomicfiles_1.26.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/genomicfiles.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包/基因组文件
包短网址	https://biocumon.org/packages/genomicfiles/
包裹下载报告	下载统计信息