GenomicSupersignature

doi：10.18129/b9.bioc.genomicsupersignature

通过与公共数据库进行稳健，有效的比较来解释RNA-seq实验

生物导体版本：版本（3.15）

该软件包提供了一种新颖的方法，可以通过与公共档案馆的近乎构成比较来解释新的转录组数据集，而没有高性能计算要求。通过预先计算的索引，用户可以识别与其数据集相关的公共资源，例如基因集，网格术语和出版物。在此软件包中实现了确定可解释的注释和直观可视化选项的功能。

作者：Sehyun OH [AUT，CRE]，Levi Waldron [AUT]，Sean Davis [aut]

维护者：sehyun oh

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ GenomicSuperSignature”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“基因组启动”）

html	R脚本	Ravmodel的介绍
html	R脚本	快速开始
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 4.1.0），总结性特征
进口	复杂的图像，，，，GGPLOT2， 方法，S4VECTORS，，，，生物酶，，，，ggpubr，，，，dplyr，，，，情节，，，，Biocfilecache， 网格，可弹
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，DevTools，，，，roxygen2，，，，pkgdown，，，，用这个，，，，生物使用，，，，测试，，，，福卡，统计WordCloud，，，，循环，，，，富集兄弟，，，，clusterProfiler，，，，msigdbr，，，，簇，，，，rcolorbrewer，，，，RESHAPE2，，，，蒂布尔，，，，生物管理器，，，，bcellviper，，，，readr，UTILS
系统要求
增强
URL	https://github.com/shbrief/genomicsupersignature
BugReports	https://github.com/shbrief/genomicsupersignature/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	genomicsupersignature_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	genomicsupersignature_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	genomicsupersignature_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/genomicsupersignature
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/genomicsupersignature
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/genomicsupersignature/
软件包下载报告	下载统计