Glimma

DOI:10.18129 / B9.bioc.Glimma

交互的HTML图形

Bioconductor版本:发行版(3.12)

该包使用HTML页面中的limma、edgeR或DESeq2包的输出生成rna测序数据分析的交互式可视化。交互建立在分析结果的流行静态表示的基础上，以便提供额外的信息。

作者:shan Su [aut, cre]， Hasaru Kariyawasam [aut]， Oliver Voogd [aut]， Matthew Ritchie [aut]， Charity Law [aut]， Stuart Lee [ctb]， Isaac Virshup [ctb]

维护者:Shian Su < Su。年代在wehi.edu.au >

安装

要安装此包，启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("Glimma")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请从R开始并输入:

browseVignettes(“Glimma”)

超文本标记语言	R脚本	DESeq2
超文本标记语言	R脚本	limma
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	2.0.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	htmlwidgets，刨边机，DESeq2，limma，SummarizedExperiment统计数据,jsonlite、方法、S4Vectors
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，IRanges，GenomicRanges，pryr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/hasaru-k/GlimmaV2
BugReports	https://github.com/hasaru-k/GlimmaV2/issues
取决于我	RNAseq123
进口我	affycoretools，EGSEA
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	Glimma_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	Glimma_2.0.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	Glimma_2.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Glimma
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Glimma
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/Glimma/
包下载报告	下载数据