GlobalAncova

DOI:10.18129 / B9.bioc.GlobalAncova

通过模型比较对变量组进行全局检验

生物导体版本:发布(3.12)

一个感兴趣的变量(如两组)和一组变量(如一组基因)之间的关联是通过全局f检验来检验的。我们给出以下论点来支持GlobalAncova方法:经过适当的规范化，基因表达数据看起来相当对称，异常值不是真正的问题，所以最小二乘应该相当稳健。具有交互作用的ANCOVA可产生饱和数据模型，如每组和基因的不同平均数。协变量调整可以帮助纠正可能的选择偏差。方差同质性和不相关残差不能被期望。应用普通最小二乘给出无偏的，但不再是最优估计(高斯-马尔可夫-艾特肯)。因此，由于相关性，使用经典的f检验是不合适的。然而，检验统计量反映了与原假设的偏差。结合置换方法，经验显著性水平可以近似。或者，近似值产生渐近的p值。 The framework is generalized to groups of categorical variables or even mixed data by a likelihood ratio approach. Closed and hierarchical testing procedures are supported. This work was supported by the NGFN grant 01 GR 0459, BMBF, Germany and BMBF grant 01ZX1309B, Germany.

作者:U. Mansmann, R. Meister, M. Hummel, R. Scheufele, S. Knueppel

维护人员:Manuela Hummel < Manuela。无角的在web.de >

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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	4.8.0
Bioconductor自	BioC 1.7 (R-2.2)(15.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	方法,corpcor,globaltest
进口	注释,AnnotationDbi,Biobase,dendextend,GSEABase,VGAM
链接
建议	GO.db,KEGG.db,golubEsets,hu6800.db,vsn,Rgraphviz
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包档案

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源包	GlobalAncova_4.8.0.tar.gz
Windows二进制	GlobalAncova_4.8.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	GlobalAncova_4.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GlobalAncova
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GlobalAncova
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/GlobalAncova/
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