GMICR

doi:10.18129/b9.bioc.gmicr

将WGCNA和XCELL读数与贝叶斯网络结合在一起,以生成基因模块免疫细胞网络(GMIC)

生物导体版本:版本(3.13)

该软件包使用贝叶斯网络学习来检测WGCNA检测到的基因模块与XCELL定义的免疫细胞特征之间的关系。这是一种假设生成工具。

作者:Richard Virgen-Slane

维护者:gmail.com>

引用(从r内,输入引用(“ GMICR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gmicr”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ gmicr”)

html R脚本 gmicr_vignette
PDF 参考手册
文本 执照

细节

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版本 1.6.0
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(1。5年)
执照 GPL-2 +文件执照
要看
进口 AnnotationDbi,,,,,,,,Bnlearn,,,,类别,,,,DT,,,,多帕尔,,,,foreach,,,,Grbase,,,,gseabase,,,,粮食,,,,gostats,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,闪亮的,,,,WGCNA,,,,Data.Table,grdevices,图形,RESHAPE2,统计,utils
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包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gmicr_1.6.0.tar.gz
Windows二进制 gmicr_1.6.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) gmicr_1.6.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gmicr
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/gmicr
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/gmicr/
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