哈曼

DOI：10.18129 / b9.bioc.harman.

使用PCA和受约基于优化的技术从数据集中删除批量效应

Biocometiond版本：释放（3.12）

哈曼is a PCA and constrained optimisation based technique that maximises the removal of batch effects from datasets, with the constraint that the probability of overcorrection (i.e. removing genuine biological signal along with batch noise) is kept to a fraction which is set by the end-user.

作者：Josh Bowden [Aut]，Jason Ross [Aut，Cre]，Yalchin Oytam [Aut]

维护者：杰森罗斯

安装

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文件

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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版	1.18.0
在生物导体中以来	BIOC 3.3（R-3.3）（4.5岁）
执照	GPL-3 +文件许可证
依靠	r（> = 3.6）
进口	rcpp.（> = 0.11.2），图形，统计，方法
链接到	rcpp.
建议	HARMANDATA那生物根系那生物焦那kn那RAMAMAMDOW.那运行那rcolorbrewer.那Bladderbatch.那林马那Minfi.那lumi.那msmseda.那yefydata.那minfidata.那SVA.
系统要求
加强
URL.	http://www.bioinformatics.csiro.au/harman/
Bugreports.	https://github.com/jasonr055/harman/issues.
取决于我
进口我	德布雷斯勒
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随安装在r会话中使用此包的说明。

源包	HARMAN_1.18.0.tar.gz.
Windows二进制文件	HARMAN_1.18.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	HARMAN_1.18.0.TGZ.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/harman.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocumon.org：包裹/哈曼
包短网址	https://biocumon.org/packages/harman/
包裹下载报告	下载统计信息