HITC

doi：10.18129/b9.bioc.hitc

高通量染色体构象捕获分析

生物导体版本：版本（3.13）

开发了HITC软件包，以探索高通量“ C”数据，例如5C或HI-C。还提供了专用的R类以及质量控制，标准化，可视化和进一步分析的标准方法。

作者：尼古拉斯仆人

维护者：尼古拉斯仆人

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ hitc”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ HITC”）

PDF	R脚本	HI-C数据分析使用HITC
PDF	R脚本	HITC包装简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.36.0
在生物导体中	Bioc 2.10（R-2.15）（9年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 2.15.0），方法，iranges，，，，基因组机
进口	生物弦，图形，grdevices，rtracklayer，，，，rcolorbrewer，，，，矩阵， 平行，GenomeInfodB
链接
建议	生物使用，，，，Hicdatahumanimr90
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	Hicdatahumanimr90，，，，hicdcplus
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	hitc_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	hitc_1.36.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	hitc_1.36.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/hitc
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/hitc
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/hitc/
软件包下载报告	下载统计