IPO

doi：10.18129/b9.bioc.ipo

XCMS数据处理参数的自动优化

生物导体版本：版本（3.15）

XCMS数据处理的结果在很大程度上取决于参数设置。IPO（`iSotopologue参数优化“）是一种参数优化工具，适用于不同种类的样品和液相色谱法与高分辨率质谱设备耦合，快速且无标记步骤。IPO使用天然稳定的13C同位素来计算峰采摘分数。通过最小化特征内的相对保留时间差异，通过最大化分组参数来优化保留时间校正，通过最大化特征的数量来优化分组参数的数量，从每次注入汇总样品的每次注射中恰好一个峰。通过设计实验可以实现不同的参数设置。使用响应表面模型评估所得的分数。

作者：gunnar libiseller ，Christoph Magnes ，Thomas Riebenbauer >

维护者：托马斯·里本鲍尔（Thomas Riebenbauer

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ IPO”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ IPO”）

html	R脚本	IPO的XCMS参数优化
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.21.0
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年）
执照	GPL（> = 2） +文件执照
要看	XCMS（> = 1.50.0），RSM，，，，相机，grdevices，图形，统计，utils
进口	生物比较
链接
建议	运行，，，，生物基因，，，，MSDATA，，，，mtbls2，，，，法阿科，，，，尼特
系统要求
增强	平行
URL	https://github.com/rietho/ipo
BugReports	https://github.com/rietho/ipo/issues/new
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ipo_1.21.0.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13（高山脉）
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ipo
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/IPO
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/ipo/
软件包下载报告	下载统计