inpas.

DOI：10.18129 / b9.bioc.inpas.

用于鉴定来自RNA-SEQ数据的新型替代聚腺苷酸化位点（PAS）的生物导体包装

Bioconductor版本：释放（3.13）

替代的多腺苷酸化（APA）是大多数人基因中发生的重要转录后调节机制之一。Inpas有助于从RNA-SEQ数据发现新型APA站点和APA站点的差异使用。它通过删除虚假网站利用CleanUpdtseq对微调识别的APA站点。

作者：建红欧[自豪，CRE]，海博刘[AUT]，Lihua Julie Zhu [Aut]，Sungmi M. Park [Aut]，Michael R. Green [Aut]

维护者：建红欧<建虹。杜克·德杜>

安装

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if（！quancamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“Inpas”）

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Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	2.0.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.1（R-3.2）（6年）
执照	GPL（> = 2）
依靠	R（> = 3.1），方法，BioBase.那Genomicranges.那S4Vectors.
进口	annotationdbi.那bsgenome.那Cleanupdtseq.那预处理核那绞喉那genomeinfodb.那DEPMIXS4.那林马那生物相投那生物仪器那dplyr.那Magrittr.那普利兰语那读书那rsqlite.那DBI.那邮风那基因组法那ggplot2.那重塑2.
链接到
建议	运行那生物根系那Biocmanager.那rtracklayer.那生物焦那kn那啰嗦那RAMAMAMDOW.那ensdb.hsapiens.v86那ensdb.mmusculus.v79.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19那bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那txdb.mmusculus.ucsc.mm10.knowngene.
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包档案包

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源包	Inpas_2.0.0.tar.gz.
Windows二进制文件	Inpas_2.0.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	Inpas_2.0.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/inpas.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包装/ inpas
包短网址	https://biocumon.org/packages/inpas/
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