Bioconductor版本:释放(3.13)
该包装的重点是检测在拓扑相关的结构域(TAD)或染色质接触环锚之间的表达基因和从芯片-SEQ数据中获得的增强剂之间的相关性的相关性(即从芯片-SEQ数据获得的增强剂)。可以控制各种参数来研究外部因素的影响,并且可用于每个分析步骤的可视化图。
作者:Konstantin Okonechnikov,Serap Erkek,Lukas Chavez
维护者:Konstantin Okonechnikov
引文(从R内,输入引文(“Intad”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“Intad”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“INTAD”)
HTML. | r script. | 表观遗传信号与基因在TADS中的相关性 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.7(R-3.5)(3年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | R(> = 3.5),方法,S4Vectors.那绞喉那Genomicranges.那MultiAsaySayexperiment.那概括分析,统计数据 |
进口 | 生物根系那BioBase.那rtracklayer.,平行,图形,蒙链那qvalue.那ggplot2.,实用,ggpubr. |
链接到 | |
建议 | testthat.那生物焦那kn那RAMAMAMDOW. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | IntaD_1.12.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | IntaD_1.12.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | IntaD_1.12.0.TGZ. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/intad. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondudard.org:包装/ Intad |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/intad/ |
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