兴趣

DOI：10.18129 / b9.bioc.interest.

内含子保留估计

Biocometiond版本：释放（3.12）

此包对RNA-SEQ数据（.BAM文件）执行内外内外保留分析。

作者：Ali Oghabian ，达里奥尔克西奥，Mikko Fililander

维护者：赫尔辛基的Ali Oghabian ，Mikko Fililander

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“兴趣”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

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HTML.	r script.	兴趣，内含子外显子保留估计
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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.14.0
在生物导体中以来	BIOC 3.5（R-3.4）（4年）
执照	GPL-2
依靠	r（> = 3.4），Genomicranges.那RSAMTOOLS.那概括分析那edger.那S4Vectors.
进口	seqlogo.那生物仪器那基因组法（> = 1.39.4），绞喉那Seqinr.，图形，grdevices，stats，utils，网格，方法，DBI.那RMYSQL.那基因管理那生物相投那生物根系那Dexseq.那deseq2.
链接到
建议	Clinfun.那kn那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	兴趣_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件	兴趣_1.14.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	兴趣_1.14.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/interest.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包裹/兴趣
包短网址	https://biocumon.org/packages/interest/
包裹下载报告	下载统计信息