Intercellar

doi：10.18129/b9.bioc.intercellar

InterCellar：一个用于互动分析和单细胞转录组中细胞电池通信的R-Shiny应用程序

生物导体版本：版本（3.15）

InterCellar被实现为R/Bioconductor软件包，该软件包包含一个闪亮的应用程序，该应用程序允许用户从SCRNA-SEQ数据进行交互性分析细胞电池通信。从预先计算的配体 - 受体相互作用开始，InterCellar提供了过滤选项，注释和多个可视化，以探索簇，基因和功能。最后，基于基因本体论和途径数据库的功能注释，Intercellar实现了数据驱动的分析，以在一个或多个条件下研究细胞细胞通信。

作者：Marta Interlandi [Cre，Aut]

维护者：marta interlandi

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ InterCellar”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Intercellar”）

html	R脚本	InterCellar用户指南
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	2.2.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 4.1）
进口	config，，，，魔像，，，，闪亮的，，，，DT，，，，发光的dashboard，，，，光泽，，，，Shinycsssloaders，，，，Data.Table，，，，FS，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，循环，，，，颜色，，，，Dendextend，，，，事实，，，，GGPLOT2，，，，情节，，，，plyr，，，，Shinyfeedback，，，，Shinyalert，，，，蒂布尔，，，，UMAP，，，，Visnetwork，，，，WordCloud2，，，，readxl，，，，htmlwidgets，，，，色彩空间，，，，信号，，，，秤，，，，htmltools，，，，复杂的图像，grdevices，统计，工具，utils，Biomart，，，，rlang，，，，FMSB，，，，Igraph
链接
建议	测试（> = 3.0.0），尼特，，，，rmarkDown，，，，胶水，，，，石墨，，，，processx，，，，试图，，，，生物使用，，，，httr
系统要求
增强
URL	https://github.com/martaint/intercellar
BugReports	https://github.com/martaint/intercellar/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Intercellar_2.2.0.tar.gz
Windows二进制	Intercellar_2.2.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Intercellar_2.2.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/intercellar
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/intercellar
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/intercellar/
软件包下载报告	下载统计