InterMineR

DOI:10.18129 / B9.bioc.InterMineR

R接口与inter - powered数据库

生物导体版本:发布(3.13)

基于InterMine平台的数据库FlyMine、modMine (modENCODE)、RatMine、YeastMine、HumanMine和TargetMine是各种生物基因组、表达和蛋白质数据的集成数据库。集成数据使运行跨越生物知识领域的复杂数据挖掘查询成为可能。这个R包通过webservices提供与这些数据库的接口。它最大限度地利用了R中的数据帧对象和数据库中的表对象之间的通信，同时隐藏了通过XML或JSON进行数据交换的细节。

作者:王兵，Julie Sullivan, Rachel Lyne, Konstantinos Kyritsis, Celia Sanchez

维护人员:InterMine Team

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require ("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“InterMineR”)

超文本标记语言	R脚本	InterMineR装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.14.1
Bioconductor自	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	LGPL
取决于	R (> = 3.4.1)
进口	Biostrings，RCurl，XML，xml2，RJSONIO，sqldf，igraph，httr，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，SummarizedExperiment、方法
链接
建议	BiocStyle，Gviz，knitr，rmarkdown，GeneAnswers，GO.db，org.Hs.eg.db
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/intermine/intermineR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	InterMineR_1.14.1.tar.gz
Windows二进制	InterMineR_1.14.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	InterMineR_1.14.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/InterMineR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ InterMineR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/InterMineR/
包下载报告	下载数据
BioC 3.13的旧源包	源存档