InteractiveComplexHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.InteractiveComplexHeatmap

使交互复杂的热图

Bioconductor版本:版本(3.15)

这个包很容易使热图由ComplexHeatmap包到交互式应用程序中。它提供了两种类型的时空:1。在交互式图形设备,2。闪亮的应用。它还提供了功能整合互动的热图部件对于更复杂的闪亮的应用发展。

作者:Zuguang Gu (aut (cre)

维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“InteractiveComplexHeatmap”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“InteractiveComplexHeatmap”)

HTML	R脚本	1。如何可视化的热图交互
HTML	R脚本	2。交互式复杂的热图是如何实现的
HTML	R脚本	3所示。函数的应用发展
HTML	R脚本	4所示。装饰上的热图
HTML	R脚本	5。Interactivate热图所产生的间接pheatmap (), heatmap.2()和热图()
HTML	R脚本	6。闪亮的应用可视化DESeq2结果
HTML	R脚本	7所示。从头开始实现交互式的热图
HTML	R脚本	8。分享互动的热图的合作者
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0.0),ComplexHeatmap(> = 2.11.0)
进口	grDevices,统计数据,闪亮的、网格GetoptLong,S4Vectors(> = 0.26.1),消化,IRanges,kableExtra(> = 1.3.1),跑龙套,svglite,htmltools,clisymbols,jsonlite,RColorBrewer,fontawesome
链接
建议	knitr,rmarkdown,testthat,EnrichedHeatmap,GenomicRanges,data.table,circlize,GenomicFeatures,tidyverse,tidyHeatmap,集群,org.Hs.eg.db,simplifyEnrichment,GO.db,SC3,GOexpress,SingleCellExperiment,嘘,gplots,pheatmap,气道,DESeq2,DT,可乐,BiocManager,gridtext,HilbertCurve(> = 1.21.1),shinydashboard,SummarizedExperiment,pkgndep,ks
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/InteractiveComplexHeatmap
BugReports	https://github.com/jokergoo/InteractiveComplexHeatmap/issues
取决于我
进口我
建议我	simplifyEnrichment
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 指示在R会话中使用这个包。

源包	InteractiveComplexHeatmap_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	InteractiveComplexHeatmap_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	InteractiveComplexHeatmap_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/InteractiveComplexHeatmap
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ InteractiveComplexHeatmap
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/InteractiveComplexHeatmap/
包下载报告	下载数据