intramirexplorer.

DOI:10.18129 / b9.bioc.intramirexplorer.

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预测果蝇瘤米尔纳斯的靶标

Bioconductor版本:释放(3.13)

MIR探索器中,探索者是一体化miRNA靶预测生物信息工具,鉴定了组合给定微稻草(MIR)的表达和生物物理相互作用的靶标。使用该工具,我们已经使用了D. Melanogaster的92内瘤MIR的目标,从Affymetrix 1和Affymetrix2微阵列阵列平台提供了可用的微阵列表达数据,提供了奇节炎中的腺体MiR靶标的全球视角。预测目标根据使用David基因本体工具的生物学功能进行分组,并基于生物相关的评分系统进行排序,使用户能够识别给定MIR的功能相关的目标。

作者:Surajit Bhattacharya和Daniel Cox

维护者:surajit bhattacharya

引文(从R内,输入引文(“intramirexplorer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“Intramirexplorer”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

PDF. 参考手册

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.14.0
在生物导体中以来 BIOC 3.6(R-3.4)(3.5岁)
执照 GPL-2
依靠 r(> = 3.4)
进口 iGraph.(> = 1.0.1),FGNet.(> = 3.0.7),kn(> = 1.12.3),统计数据,UTI,GRDEVICE,图形
链接到
建议 rdavidwebservice.Gprofiler.顶点keggfrofile.org.dm.eg.db.RAMAMAMDOW.testthat.
系统要求
加强
URL. https://github.com/sbhattacharya3/intramirexplorer/
Bugreports. https://github.com/sbhattacharya3/intramirexplorer/issues.
取决于我
进口我
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包档案包

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源包
Windows二进制文件
Macos 10.13(高塞拉)
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/intramirexplorer.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ intramirexplorer
包短网址 https://biocumon.org/packages/intramirexplorer/
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