kegglincs

doi:10.18129/b9.bioc.kegglincs

可视化kegg途径中的所有边缘和覆盖lincs数据

生物导体版本:版本(3.13)

通过从KGML文件获得的信息中明确创建路径映射,查看KEGG路径的“引擎盖下方”的情况。

作者:Shana White

维护者:shana White ,Mario Meddedovic

引用(从r内,输入引用(“ kegglincs”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ kegglincs”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ kegglincs”)

html R脚本 kegglincs工作流程
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.18.0
在生物导体中 Bioc 3.4(R-3.3)(4。5年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3),科达塔,,,,HGU133A.DB,,,,org.hs.eg.db(> = 3.3.0)
进口 AnnotationDbi,,,,kegggraph,,,,Igraph,,,,plyr,,,,gtools,,,,httr,,,,rjsonio,,,,keggrest,方法,图形,统计,utils,XML,grdevices
链接
建议 生物管理器(> = 1.20.3),尼特,,,,图形
系统要求 Cytoscape(> = 3.3.0),Java(> = 8)
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 kegglincs_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 kegglincs_1.18.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) kegglincs_1.18.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/kegglincs
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/kegglincs
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/kegglincs/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户