蕾丝

doi：10.18129/b9.bioc.lace

癌症进化（蕾丝）的纵向分析

生物导体版本：版本（3.15）

蕾丝是一种算法框架，它从不同时间点和在不同的实验环境中收集的癌症样品中处理单细胞体细胞突变谱，以产生癌症进化的纵向模型。该方法通过在多个时间点计算出的称重似然函数来解决与系统发育约束的布尔矩阵分解问题。

作者：Daniele Ramazzotti [AUT]，Fabrizio Angaroni [AUT]，Davide Maspero [CRE，AUT]，Alex Graudenzi [AUT]，Luca de Sano [aut]，gianluca ascolani [aut]

维护者：Davide Maspero

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Lace”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“蕾丝”）

PDF	R脚本	蕾丝
PDF	R脚本	蕾丝2.0
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	2.0.0
在生物导体中	Bioc 3.11（R-4.0）（2年）
执照	文件执照
要看	R（> = 4.1.0）
进口	卷曲，，，，Igraph，，，，foreach，，，，多帕尔，，，，可分类，，，，dplyr，，，，data.tree，图形，grdevices，并行，rcolorbrewer，，，，rfast，统计总结性特征，utils，purrr，，，，Stringi，，，，Stringr，，，，矩阵，，，，花花公子，，，，jsonlite，，，，readr，，，，席，，，，DT， 工具，FS，，，，Data.Table，，，，htmltools，，，，htmlwidgets，，，，BSPlus，，，，闪亮的，，，，有光泽的人，，，，光泽，，，，Shinyjs，，，，丝绸，，，，发光的dashboard，，，，Biomart，，，，callr
链接
建议	生物基因，，，，生物使用，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL	https://github.com/bimib-disco/lace
BugReports	https://github.com/bimib-disco/lace
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	lace_2.0.0.tar.gz
Windows二进制	lace_2.0.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	lace_2.0.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lace
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/蕾丝
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/lace/
软件包下载报告	下载统计