LPE

doi:10.18129/b9.bioc.lpe

使用本地合并错误(LPE)方法分析微阵列数据的方法

生物导体版本:版本(3.15)

该LPE库用于对微阵列数据进行显着分析,并具有少量的重复分析。它使用基于重新采样的FDR调整,比传统的“ BH”或“通过”程序提供的保守结果较少。接受的数据是MAS4,MAS5或DCHIP的TXT格式的原始数据。标准化后也可以提供数据。LPE库主要用于分析两个条件之间的数据。要将其用于配对数据,请参见LPEP库。要在多种条件下使用LPE,请使用下摆库。

作者:nitin Jain ,Michael O'Connell ,Jae K. Lee

维护者:nitin Jain

引用(从r内,输入引用(“ LPE”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ LPE”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ LPE”)

PDF R脚本 LPE测试用于少量重复的微阵列数据
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.70.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 17年)
执照 LGPL
要看 R(> = 2.10)
进口 统计
链接
建议
系统要求
增强
URL http://www.r-project.orghttp://www.healthsystem.virginia.edu/internet/hes/biostat/bioinformatics/http://sourceforge.net/projects/r-lpe/
取决于我 lpeadj,,,,PLPE
进口我 lpeadj
建议我 Abarray
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 lpe_1.70.0.0.tar.gz
Windows二进制 LPE_1.70.0.ZIP
MacOS 10.13(高山脉) lpe_1.70.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lpe
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/lpe
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/lpe/
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