linnorm

doi：10.18129/b9.bioc.linnorm

线性模型和基于正态性的归一化和转换方法（Linnorm）

生物导体版本：版本（3.15）

Linnorm是一种用于标准化和转换RNA-Seq，单细胞RNA-Seq，ChIP-Seq计数数据或任何大规模计数数据的算法。Tian等人已经独立审查了它。关于自然方法（https://doi.org/10.1038/s41592-019-0425-8）。Linnorm可以与原始计数，CPM，RPKM，FPKM和TPM一起使用。

作者：shun hang yip ，panwen wang ，jean-pierre kocher at mayo.edu>，pak chung chung chung chung chung ，junwen wang wang junwen wang

维护者：ken shun hang yip 的shunyip>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ linnorm”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Linnorm”）

PDF	R脚本	Linnorm用户手册
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	2.20.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 4.1.0）
进口	RCPP（> = 0.12.2），rcpparmadillo（> = 0.8.100.1.0），FPC，，，，素食主义者，，，，mclust，，，，APCLUSTER，，，，GGPLOT2，，，，椭圆，，，，林玛，utils，Statmod，，，，大量的，，，，Igraph，grdevices，图形，快速积分，，，，ggdendro，，，，动物园，统计一张地图，，，，RTSNE，，，，Gmodels
链接	RCPP，，，，rcpparmadillo
建议	生物使用，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，降价，，，，GPLOTS，，，，rcolorbrewer，，，，时刻，，，，测试
系统要求
增强
URL	https://doi.org/10.1093/nar/gkx828
取决于我
进口我	mnem
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	linnorm_2.20.0.tar.gz
Windows二进制	linnorm_2.20.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	linnorm_2.20.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/linnorm
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/linnorm
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/linnorm/
软件包下载报告	下载统计