LowMACA

DOI:10.18129 / B9.bioc.LowMACA

LowMACA -通过一致性比对的低频突变分析

Bioconductor版本:Release (3.15)

LowMACA包是一套简单的工具,通过一致性对齐来调查和分析几种蛋白质或pfam结构域的突变谱。您可以使用我们的软件包进行假设驱动的探索性分析,只需提供一组您感兴趣的基因或pfam域。

作者:Stefano de Pretis, Giorgio Melloni

维护者:Stefano de Pretis , Giorgio Melloni < Melloni。乔治在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“LowMACA”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“LowMACA”)

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细节

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版本 1.25.0
在Bioconductor BioC 3.1 (R-3.2)(7年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 2.10)
进口 cgdsr,平行,stringrreshape2data.tableRColorBrewer、方法、LowMACAAnnotationBiocParallelmotifStackBiostringshttr、网格gridBase
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements Clustalo, gs, perl
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 LowMACA_1.25.0.tar.gz
Windows二进制 LowMACA_1.25.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) LowMACA_1.25.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/LowMACA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/LowMACA
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/LowMACA/
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