淋巴索

doi：10.18129/b9.bioc.lymphoseq

分析T和B细胞受体的高通量测序

生物导体版本：版本（3.15）

该R包分析了T和B细胞受体互补性的高通量测序确定由自适应生物技术的Immunoseq分析产生的区域3（CDR3）序列。它的输入来自从Immunoseq分析仪导出的TAB分隔值（.TSV）文件。

作者：David Coffey

维护者：David Coffey

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ lymphoseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“淋巴索”）

html	R脚本	分析用淋巴糖的T和B细胞受体的高通量测序
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.24.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 3.3），淋巴结杆菌
进口	Data.Table，，，，plyr，，，，dplyr，，，，重塑，，，，Venndiagram，，，，GGPLOT2，，，，ineq，，，，rcolorbrewer，，，，循环，网格，utils，统计，格特里，，，，MSA，，，，生物弦，，，，Phangorn，，，，字符串，，，，insctr
链接
建议	尼特，，，，pheatmap，，，，WordCloud，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Lymphoseq_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	Lymphoseq_1.24.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Lymphoseq_1.24.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/lymphoseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/淋巴索
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/lymphoseq/
软件包下载报告	下载统计