- 家
- Biocumon 3.13
- 软件包
- Madseq.
Madseq.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.madseq.
使用大规模平行测序数据的马赛克非综合体检测和定量
Bioconductor版本：释放（3.13）
Madseq包提供了一组用于检测马赛克非洲倍性的分层Bayeisan模型，不倍性类型的推理以及用于定量样品中的空腹细胞的级分。
作者：Yu Kong，Adam Auton，John Murray Geally
维护者：Yu Kong
引文（从R内，输入引文（“Madseq”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！properenamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“madseq”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
Browsevignettes（“Madseq”）
| HTML. | r script. | R包Madseq. |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.18.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.4（R-3.3）（4.5岁） |
| 执照 | GPL（> = 2） |
| 依靠 | r（> = 3.4），rjags.（> = 4-6） |
| 进口 | vgam.那结尾那bsgenome.那bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.那S4Vectors.， 方法，预处理核那基因管理那RSAMTOOLS.那生物仪器那Genomicranges.那绞喉那VariantAnnotation.那概括分析那genomeinfodb.那rtracklayer.，图形，统计数据，grdevices，utils，Zlibbioc.那VCFR. |
| 链接到 | |
| 建议 | kn |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | https://github.com/ykong2/madseq. |
| Bugreports. | https://github.com/ykong2/madseq/issues. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | madseq_1.18.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | madseq_1.18.0.zip.（32-＆64位） |
| Macos 10.13（高塞拉） | Madseq_1.18.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/madseq. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包装/ Madseq |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/madseq/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
