玛格尔

doi：10.18129/b9.bioc.magar

MAGAR：从DNA甲基化和基因分型数据计算甲基化定量性状基因座（METHQTL）的R包装

生物导体版本：版本（3.15）

“ R中的甲基化感知基因型关联”（MAGAR）从DNA甲基化和匹配样品中的基因分型数据中计算出METHQTL。Magar使用线性建模散文来调用METHQTL的CPGS/SNP。MAGAR是CPG的局部相关结构。

作者：Michael Scherer [CRE，AUT]

维护人员：Michael Scherer 的MSCHERER>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ magar”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Magar”）

html	R脚本	MAGAR：R中的甲基化感知基因型关联
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1年）
执照	GPL-3
要看	r（> = 4.1），HDF5Array，，，，rnbeads，，，，snpstats，，，，crlmm
进口	多帕尔，，，，Igraph，，，，Bigstatsr，，，，rjson，，，，plyr，，，，Data.Table，，，，insctr，，，，RESHAPE2，，，，jsonlite， 方法，ff，，，，argparse，，，，算，，，，rnbeads.hg19，utils，统计
链接
建议	栅格，，，，Venndiagram，，，，QQMAN，，，，萝拉，，，，运行，，，，rmutil，，，，rmarkDown，，，，Jaspar2018，，，，TFBSTOOLS，，，，seqlogo，，，，尼特，，，，DevTools，，，，生物基因，，，，生物管理器
系统要求
增强
URL	https://github.com/mpiicomputational Epigenetics/magar
BugReports	https://github.com/mpiicomputational Epigenetics/magar/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	magar_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	magar_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	magar_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/magar
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/magar
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/magar/
软件包下载报告	下载统计