mbt

DOI:10.18129 / B9.bioc.MBttest

多重Beta t检验

Bioconductor版本:发行版(3.13)

MBttest方法是由Baggerly等(2003)的beta t检验方法发展而来。与baySeq (Hard castle and Kelly 2010)、DESeq (Anders and Huber 2010)、精确检验(Robinson and Smyth 2007, 2008)和McCarthy et al(2012)的GLM相比,MBttest具有较高的工作效率,即具有高幂次、高FDR估计保守性和高稳定性。MBttest适用于小样本或少量复制库中的转录组数据、标记数据、SAGE数据(计数数据)。它可以用来识别基因,mRNA异构体或标签在两种条件下差异表达。

作者:谭元德

维护人员:Tan Yuan-De

引文(从R内,输入引用(mbt)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MBttest")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes (mbt)

PDF R脚本 使用“MBttest”软件包分析RNA-Seq计数数据
PDF MBttest-manual.pdf
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细节

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版本 1.20.0
在Bioconductor BioC 3.3 (R-3.3)(5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.3.0), stats,gplotsgtools,图形,基础,utils, grDevices
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包 MBttest_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 MBttest_1.20.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) MBttest_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBttest
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MBttest
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/MBttest/
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