Bioconductor版本:发行版(3.13)
MBttest方法是由Baggerly等(2003)的beta t检验方法发展而来。与baySeq (Hard castle and Kelly 2010)、DESeq (Anders and Huber 2010)、精确检验(Robinson and Smyth 2007, 2008)和McCarthy et al(2012)的GLM相比,MBttest具有较高的工作效率,即具有高幂次、高FDR估计保守性和高稳定性。MBttest适用于小样本或少量复制库中的转录组数据、标记数据、SAGE数据(计数数据)。它可以用来识别基因,mRNA异构体或标签在两种条件下差异表达。
作者:谭元德
维护人员:Tan Yuan-De
引文(从R内,输入引用(mbt)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("MBttest")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes (mbt)
R脚本 | 使用“MBttest”软件包分析RNA-Seq计数数据 | |
MBttest-manual.pdf | ||
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.20.0 |
在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.3.0), stats,gplots,gtools,图形,基础,utils, grDevices |
进口 | |
链接 | |
建议 | BiocStyle,BiocGenerics |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。
源包 | MBttest_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | MBttest_1.20.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | MBttest_1.20.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MBttest |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MBttest |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/MBttest/ |
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