米拉

DOI:10.18129 / b9.bioc.mira.

基于甲基化的监管活动推断

Bioconductor版本:释放(3.13)

DNA甲基化含有有关细胞调节状态的信息。MIRA将基因组DNA甲基化数据聚集成具有共同生物注释的给定区域的DNA甲基化分布。使用此配置文件,Mira Infers并评分区域集的集体监管活动。Mira促进了在古典监管检验困难的情况下的监管分析,并且允许公共来源设定,以便对DNA甲基化数据集的调节状态进行新的洞察。

作者:Nathan Sheffield [Aut],Christoph Bock [CTB],John Lawson [Aut,Cre]

维护者:John Lawson

引文(从R内,输入引文(“Mira”)):

安装

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版本 1.14.0
在生物导体中以来 BIOC 3.6(R-3.4)(3.5岁)
执照 GPL-3
依靠 r(> = 3.5)
进口 生物根系S4Vectors.绞喉Genomicranges.data.table.ggplot2.BioBase.,统计,BSSeq., 方法
链接到
建议 kn, 平行,testthat.生物焦RAMAMAMDOW.annotationhub.萝拉
系统要求
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URL. http://databio.org/mira.
Bugreports. https://github.com/databio/mira.
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源包 mira_1.14.0.tar.gz.
Windows二进制文件 mira_1.14.0.zip.(32-&64位)
Macos 10.13(高塞拉) mira_1.14.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/mira.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包装/米拉
包短网址 https://biocumon.org/packages/mira/
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