生物导体版本:版本(3.13)
mmuphin是用于微生物组队列的荟萃分析任务的R包。它具有以下功能接口:a)协变量控制的批处理和队列效应调整,b)荟萃分析差异丰度测试,c)荟萃分析无监督的离散结构(群集)发现,以及d)元分析无治疗持续结构发现发现。
作者:Siyuan MA
维护者:siyuan ma
引用(从r内,输入引用(“ mmuphin”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mmuphin”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ mmuphin”)
html | R脚本 | mmuphin |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.6.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.10(R-3.6)(1。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | R(> = 3.6) |
进口 | Maaslin2,,,,元,,,,FPC,,,,Igraph,,,,GGPLOT2,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,牛仔图,utils,统计,grdevices |
链接 | |
建议 | 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,马格里特,,,,素食主义者,,,,门索,,,,策划的元素元素,,,,GeneFilter |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | mmuphin_1.6.1.tar.gz |
Windows二进制 | mmuphin_1.6.1.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mmuphin |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/mmuphin |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/mmuphin/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
Bioc 3.13的旧源软件包 | 来源存档 |
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