mmuphin

doi:10.18129/b9.bioc.mmuphin

微生物组研究中的异质性均匀管道的荟萃分析方法

生物导体版本:版本(3.13)

mmuphin是用于微生物组队列的荟萃分析任务的R包。它具有以下功能接口:a)协变量控制的批处理和队列效应调整,b)荟萃分析差异丰度测试,c)荟萃分析无监督的离散结构(群集)发现,以及d)元分析无治疗持续结构发现发现。

作者:Siyuan MA

维护者:siyuan ma

引用(从r内,输入引用(“ mmuphin”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ mmuphin”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ mmuphin”)

html R脚本 mmuphin
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.6.1
在生物导体中 Bioc 3.10(R-3.6)(1。5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.6)
进口 Maaslin2,,,,,,,,FPC,,,,Igraph,,,,GGPLOT2,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,牛仔图,utils,统计,grdevices
链接
建议 测试,,,,生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,马格里特,,,,素食主义者,,,,门索,,,,策划的元素元素,,,,GeneFilter
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 mmuphin_1.6.1.tar.gz
Windows二进制 mmuphin_1.6.1.zip
MacOS 10.13(高山脉)
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mmuphin
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/mmuphin
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/mmuphin/
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