mpranalyze

doi:10.18129/b9.bioc.mpranalyze

MPRA数据的统计分析

生物导体版本:版本(3.15)

Mpranalyze提供了统计框架,用于分析由大规模平行的报告基因测定(MPRA)生成的数据,用于直接测量增强子活性。Mpranalyze可用于定量增强剂活性,主动增强子的分类以及条件之间增强剂活性的比较分析。mpranalyze构建了一对嵌套的广义线性模型(GLM),以将DNA和RNA观测值与各种实验设计和条件相关联,并提供一组严格的统计睾丸方案。

作者:Tal Ashuach [AUT,CRE],David S Fischer [AUT],Anat Kriemer [CTB],Fabian J Theis [CTB],Nir Yosef [CTB],

维护者:tal aShuach

引用(从r内,输入引用(“ mpranalyze”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)Biocmanager :: install(“ mpranalyze”)

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文档

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Browsevignettes(“ mpranalyze”)

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版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.8(R-3.5)(3.5岁)
执照 GPL-3
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进口 生物比较, 方法,进步,统计总结性特征
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URL https://github.com/yoseflab/mpranalyze
BugReports https://github.com/yoseflab/mpranalyze
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源包 mpranalyze_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 mpranalyze_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) mpranalyze_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mpranalyze
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/mpranalyze
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/mpranalyze/
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