msnbase.

DOI：10.18129 / b9.bioc.msnbase.

质谱和蛋白质组学的基础功能和类

Biocometiond版本：释放（3.12）

MSNBase提供了用于操纵，处理和可视化的基础设施，用于质谱和蛋白质组学数据，从RAW到定量和注释数据。

作者：Laurent Gatto，Johannes Rainer和Sebastian Gibb，来自广东宇，塞缪尔·维藏，Vasile-Cosmin Lazar，Vladislav Petyuk，Thomas Naake，Richie棉，Arne Smits，Martina Fisher，Ludger Goeminne，Adriaan贴纸和Lieven Clement。

维护者：Laurent Gatto

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！quancamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“msnbase”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“MSNBASE”）

HTML.	r script.	“Msnbase”开发的简短介绍
HTML.	r script.	基于MS的蛋白质组学的基础函数和类
HTML.	r script.	MSNBase基准测试
HTML.	r script.	MSNBASE IO能力
HTML.	r script.	MSNBASE：配置文件模式MS数据的绝中心
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	2.16.1.
在生物导体中以来	BIOC 2.8（R-2.13）（10年）
执照	艺术-2.0
依靠	R（> = 3.5），方法，生物根系（> = 0.7.1），BioBase.（> = 2.15.2），MZR.（> = 2.19.6），S4Vectors.那语言机构（> = 1.19.3）
进口	生物相投那绞喉（> = 2.13.28），普利尔那预处理核那VSN.，网格，统计数据4，敬服那赋予那pcamethods.那马尔代表（> = 1.16），mzid.（> = 1.5.2），消化那格子那ggplot2.那XML.那秤那大量的那rcpp.
链接到	rcpp.
建议	testthat.那椒盐粉那格拉底那Microbenchmark.那动物园那kn（> = 1.1.0），rols.那RDISOP.那ProMoC.那prolocdata.（> = 1.7.1），msdata.（> = 0.19.3），Roxygen2.那rgl.那RPX.那annotationhub.那生物焦（> = 2.5.19），RAMAMAMDOW.那Imputelcmd.那规范那贡献那闪亮的那Magrittr.那概括分析
系统要求
加强
URL.	https://lgatto.github.io/msnbase.
Bugreports.	https://github.com/lgatto/msnbase/issues.
取决于我	autotuner.那METCIRC那msmseda.那msmstests.那ProMoC.那prolocdata.那ProloCGUI.那蛋白质组学那qplexAnalyzer.那林葛普查组织那扳机那XCMS.
进口我	康普斯那Clumsid.那达巴马尔那Dapardata.那张那msnid.那MSSTATSQC那峰坦坦那p那王子那ProteomicsannotationHubData.那qplexdata.那rmassbank.那Topdownr.
建议我	annotationhub.那生物室那生物根系那等待者那msdata.那博士那qcmetrics.那WPM.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	msnbase_2.16.1.tar.gz.
Windows二进制文件	msnbase_2.15.7.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	msnbase_2.16.1.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/msnbase.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ msnbase
包短网址	https://biocumon.org/packages/msnbase/
包裹下载报告	下载统计信息
BIOC 3.12的旧源包	源档案