Maaslin2.

DOI：10.18129 / b9.bioc.maaslin2.

Maaslin2.

Biocometiond版本：释放（3.12）

Maaslin2是全面的R包，可有效地确定临床元数据与微生物元特征之间的多变量关联。Maaslin2依赖于一般线性模型，以适应大多数现代流行病学研究设计，包括横截面和纵向，提供各种数据探索，归一化和转换方法。Maaslin2是下一代Maaslin。

作者：Himel Mallick [Aut]，Ali Rahnavard [Aut]，Lauren Mciver [Aut，CRE]

维护者：Lauren Mciver

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“maaslin2”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Maaslin2”）

HTML.	r script.	Maaslin2.
PDF.		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在生物导体中以来	BIOC 3.10（R-3.6）（1.5年）
执照	mit +文件执照
依靠	r（> = 3.6）
进口	robustbase.那big那PCAPP.那edger.那MetagenomeSQ.那lpsymphony那pbapply.那车那dplyr.那素食主义者那化学仪表那ggplot2.那Pheatmap.那记录那data.table.那最乐趣那哈希那OptParse.那m，grdevices，stats，utils，glmmtmb.那大量的那CPLM.那PSCL.
链接到
建议	kn那testthat.（> = 2.1.0）
系统要求
加强
URL.	http://huttenhower.sph.harvard.edu/maaslin2.
Bugreports.	https://github.com/biobakery/maaslin2/issues.
取决于我
进口我	mmuphin.
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	maaslin2_1.4.0.tar.gz.
Windows二进制文件	maaslin2_1.4.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	maaslin2_1.4.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/maaslin2.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/ maaslin2
包短网址	https://biocumon.org/packages/maaslin2/
包裹下载报告	下载统计信息