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Matrixrider.
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DOI：10.18129 / b9.bioc.matrixrider
在给定序列上获得绑定站点矩阵的总亲和力和占用
Bioconductor版本：释放（3.13）
计算整个序列的单个数字，反映DNA结合蛋白的倾向与其相互作用。必须用PFM矩阵描述DNA结合蛋白，例如从JASPAR中得到的。
作者：埃琳娜草
维护者：Elena Grassi
引文（从R内，输入引文（“matrixrider”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“matrixrider”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
Browsevignettes（“Matrixrider”）
| PDF. | r script. | 完全亲和力和占用 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.24.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.1（R-3.2）（6年） |
| 执照 | GPL-3 |
| 依靠 | r（> = 3.1.2） |
| 进口 | 方法，TFBStools.那绞喉那xvector.那生物仪器 |
| 链接到 | 绞喉那xvector.那生物仪器那S4Vectors. |
| 建议 | 运行那生物根系那生物焦那JASPAR2014 |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | matrixrider_1.24.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | matrixrider_1.24.0.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | matrixrider_1.24.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/matrixrider |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondion.org：包/ matrixrider |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/matrixrider/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
