metnet

doi：10.18129/b9.bioc.metnet

从不靶向的高分辨率质谱数据中推断出代谢网络

生物导体版本：版本（3.15）

METNET包含从定量数据和高分辨率质量/电荷信息中推断代谢网络拓扑的功能。使用统计模型（包括相关性，共同信息，回归和贝叶斯统计）和定量数据（特征的强度值），可以推断出可以将其合并到共识矩阵中。特征的质量/电荷值之间计算出的质量差异将与所提供的质量/电荷差异的数据框架相匹配，指的是酶活性转化。在第三步中，将两个信息级别组合在一起，以形成从定量和结构信息中推断出的邻接矩阵。

作者：Thomas Naake [AUT，CRE]，Liesa Salzer [CTB]

维护者：thomas naake

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ metnet”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ metnet”）

html	R脚本	高分辨率代谢组学数据的工作流程
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.14.0
在生物导体中	Bioc 3.8（R-3.5）（3.5岁）
执照	GPL（> = 3）
要看	r（> = 4.0），S4VECTORS（> = 0.28.1），总结性特征（> = 1.20.0）
进口	Bnlearn（> = 4.3），生物比较（> = 1.12.0），dplyr（> = 1.0.3），GGPLOT2（> = 3.3.3），Genenet（> = 1.2.15），Genie3（> = 1.7.0），方法（> = 3.5），帕马森（> = 1.0.2），心理（> = 2.1.6），rlang（> = 0.4.10），刺（> = 0.6），统计（> = 3.6），蒂布尔（> = 3.0.5），花花公子（> = 1.1.2）
链接
建议	生物基因（> = 0.24.0），生物使用（> = 2.6.1），Glmnet（> = 4.1-1），Igraph（> = 1.1.2），尼特（> = 1.11），rmarkDown（> = 1.15），测试（> = 2.2.1），光谱（> = 1.4.1），mscoreutils（> = 1.6.0）
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	metnet_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	metnet_1.14.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	metnet_1.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metnet
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/metnet
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/metnet/
软件包下载报告	下载统计