代谢信号

doi：10.18129/b9.bioc.metabosignal

代谢信号：一种基于网络的覆盖和探索代谢和信号KEGG途径的方法

生物导体版本：版本（3.15）

代谢信号是一个R软件包，允许合并，分析和自定义代谢和信号KEGG途径。它是一种基于网络的方法，旨在探索基因（信号或酶促）和代谢物之间的拓扑关系，代表了研究代谢表型的遗传景观和调节网络的强大工具。

作者：Andrea Rodriguez-Martinez，Rafael Ayala，Joram M. Posma，Ana L. Neves，Maryam Anwar，Jeremy K. Nicholson，Marc-Emmanuel Dumas

维护者：Andrea Rodriguez-Martinez ，rafael ayala

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ apabosignal”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“代谢信号”）

html	R脚本	代谢信号
html	R脚本	代谢信号2：将KEGG与其他交互资源合并
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.26.1
在生物导体中	Bioc 3.4（R-3.3）（5。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.3）
进口	kegggraph，，，，HPAR，，，，Igraph，，，，rcurl，，，，keggrest，，，，ensdb.hsapiens.v75，统计，图形，utils，org.hs.eg.db，，，，Biomart，，，，AnnotationDbi，，，，mwastools，，，，mygene
链接
建议	运行，，，，生物基因，，，，尼特，，，，生物使用，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	MetaBosignal_1.26.1.tar.gz
Windows二进制	emabosignal_1.26.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	emabosignal_1.26.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/metabosignal
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/amebosignal
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/metabosignal/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.15的旧源软件包	来源存档