Methcp

doi：10.18129/b9.bioc.methcp

亚硫酸盐测序数据的差甲基化弧分析

生物导体版本：版本（3.13）

MECHCP是用于全基因组亚硫酸盐测序（WGBS）数据的差异甲基化区域（DMR）检测方法，它适用于除两组比较之外的广泛实验设计，例如时间课程数据。MethCP根据变化点检测来识别DMR，该检测自然会分离基因组并提供区域水平的差分分析。

作者：博伊宁·锣[AUT，CRE]

维护者：boying gong

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ methcp”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Methcp”）

html	R脚本	METHCP：用户指南
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.6.0
在生物导体中	Bioc 3.10（R-3.6）（1。5年）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 3.6.0）
进口	方法，utils，stats，S4VECTORS，，，，BSSEQ，，，，DSS，，，，甲基库，，，，DNACOPIGY，，，，基因组机，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，生物比较
链接
建议	测试，，，，尼特，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
BugReports	https://github.com/boyinggong/methcp/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	Methcp_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	MethCP_1.6.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	Methcp_1.6.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methcp
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/methcp
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/methcp/
软件包下载报告	下载统计