MotifDb

DOI:10.18129 / B9.bioc.MotifDb

蛋白质- dna结合序列基序注释集合

生物导体版本:发布(3.13)

来自14个公共来源的超过9900个注释位置频率矩阵，用于多种生物。

作者:Paul Shannon, Matt Richards

维护人员:Paul Shannon

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("MotifDb")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MotifDb”)

超文本标记语言	R脚本	一个pwm集合
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.34.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (R-2.15)(8.5年)
许可证	艺术- 2.0 |文件许可证
取决于	R(>= 3.5.0)，方法，BiocGenerics，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，Biostrings
进口	rtracklayer，splitstackshape
链接
建议	RUnit，seqLogo，BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	generegulation，motifbreakR，trena
进口我	igvR，rTRMui
建议我	ATACseqQC，DiffLogo，模因，MMDiff2，motifcounter，motifStack，profileScoreDist，PWMEnrich，rTRM，TFutils，universalmotif，vtpnet
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	MotifDb_1.34.0.tar.gz
Windows二进制	MotifDb_1.34.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MotifDb_1.34.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MotifDb
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MotifDb
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/MotifDb/
包下载报告	下载数据