mungesumstats

doi：10.18129/b9.bioc.mungesumstats

标准化GWAS的摘要统计数据

生物导体版本：版本（3.13）

* mungesumstats *软件包旨在促进GWAS摘要统计数据的标准化。它重新格式化了输入的摘要统计数据，包括SNP，CHR，BP，如果丢失的话，可以查找这些值。它还可以消除跨SNP的重复。

作者：艾伦·墨菲（Alan Murphy）[CRE]，内森·斯凯恩[aut]

维护者：Alan Murphy

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ mungesumstats”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Mungesumstats”）

html	R脚本	标准化GWAS的摘要统计格式与Mungesumstats
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.0.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（<6个月）
执照	艺术2.0
要看	R（> = 4.0）
进口	Data.Table，utils，统计，基因组机，，，，BSGENOME，，，，生物弦
链接
建议	snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch37，，，，snplocs.hsapiens.dbsnp144.grch38，，，，bsgenome.hsapiens.1000genomes.hs37d5，，，，bsgenome.hsapiens.ncbi.grch38， 方法，生物基因，，，，iranges，，，，GenomeInfodB，，，，S4VECTORS，，，，rmarkDown，，，，降价，，，，尼特，，，，测试（> = 3.0.0），insctr，，，，生物使用，，，，COVR
系统要求
增强
URL	https://github.com/neurogenomics/mungesumstats
BugReports	https://github.com/neurogenomics/mungesumstats/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	mungesumstats_1.0.0.tar.gz
Windows二进制	mungesumstats_1.0.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	mungesumstats_1.0.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mungesumstats
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/mungesumstats
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/mungesumstats/
软件包下载报告	下载统计