nbamseq

doi：10.18129/b9.bioc.nbamseq

RNA-seq数据的负二项式添加剂模型

生物导体版本：版本（3.13）

高通量测序实验随后进行差异表达分析是一种广泛使用的方法来检测基因组生物标志物。差异表达分析的基本步骤是建模基因计数与感兴趣的协变量之间的关联。NBAMSEQ一个基于广义添加剂模型的灵活统计模型，并允许在方差估计中跨基因共享信息。

作者：Xu Ren [AUT，CRE]，PEI FEN KUAN [AUT]

维护者：Xu Ren

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ nbamseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ nbamseq”）

html	R脚本	RNA-seq数据的负二项式添加剂模型
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.8.0
在生物导体中	Bioc 3.9（R-3.6）（2年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.6），总结性特征，，，，S4VECTORS
进口	deseq2，，，，MGCV（> = 1.8-24），生物比较，，，，GeneFilter，方法，统计
链接
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，GGPLOT2
系统要求
增强
URL	https://github.com/reese3928/nbamseq
BugReports	https://github.com/reese3928/nbamseq/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	nbamseq_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	nbamseq_1.8.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	nbamseq_1.8.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nbamseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/nbamseq
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/nbamseq/
软件包下载报告	下载统计