NanoMethViz

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoMethViz

可视化来自牛津纳米孔测序的甲基化数据

生物导体版本:发布(3.13)

NanoMethViz是牛津纳米孔测序中可视化甲基化数据的工具包。它可以用来探索来自Oxford Nanopore直接DNA测序的甲基化模式，包括nanopolish, f5c和megalodon。该包中的图允许可视化的甲基化图谱聚集在实验组和跨类别的基因组特征。

作者:Shian Su [cre, aut]

维护者:Shian Su < Su。年代在wehi.edu.au >

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细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (R-4.0)(0.5年)
许可证	Apache License (>= 2.0)
取决于	R(>= 4.0.0)，方法ggplot2
进口	cpp11(> = 0.2.5),readr，S4Vectors，SummarizedExperiment，bsseq，forcats，为了，AnnotationDbi，Rcpp，dplyr，data.table，e1071，fs，GenomicRanges，ggthemes，胶水，拼接而成，purrr，rlang，RSQLite，Rsamtools，尺度统计数据,stringr，宠物猫，tidyr跑龙套,withr，zlibbioc
链接	Rcpp
建议	DSS，Mus.musculus，Homo.sapiens，knitr，rmarkdown，testthat(> = 3.0.0),covr
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/shians/NanoMethViz
BugReports	https://github.com/Shians/NanoMethViz/issues
取决于我
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	NanoMethViz_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	NanoMethViz_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	NanoMethViz_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoMethViz
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NanoMethViz
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/NanoMethViz/
包下载报告	下载数据