新浪潮

DOI:10.18129 / b9.bioc.newwave.

ScrNA-SEQ的负二项式模型

Bioconductor版本:释放(3.13)

一种型号,专为SCRNA-SEQ数据而设计的维度减少和批量效应。它旨在使用防止内存复制的共享对象进行大规模并行化,并且可以与不同的批量方法一起使用,以减少时间消耗。它假设具有分散参数的数据的负二进制分布,其可以在诸如遗传中共同遍布。

作者:Federico Agostinis [Aut,Cre],Chiara Romualdi [Aut],Gabriele Sales [Aut],Davide Risso [Aut]

维护者:Federico agostinis

引文(从R内,输入引文(“纽波”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!procenameSpace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“newwave”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

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BROWSEVIGNETTES(“NewWave”)

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版本 1.2.0
在生物导体中以来 BIOC 3.12(R-4.0)(0.5岁)
执照 GPL-3
依靠 r(> = 4.0),概括分析
进口 方法,SinglecellexPeriment., 平行,IRLBA.矩阵delayedarray生物贴眼SharedObject.,统计数据
链接到
建议 testthat.RAMAMAMDOW.泼溅蒙链RTSNE.ggplot2.rcpp.生物焦kn
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Bugreports. https://github.com/fedea-/newwave/issues.
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源包 newwave_1.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件 newwave_1.2.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) newwave_1.2.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/newwave.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ newwave
包短网址 https://biocumon.org/packages/newwave/
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