PFP

doi:10.18129/b9.bioc.pfp

r r的路径指纹框架

生物导体版本:版本(3.15)

纸质指纹框架的实现,该途径框架在纸质“途径指纹:一种基于生物标志物发现和表征的基于新型途径知识和拓扑的方法”中引入。该方法提供了基因集(例如差异表达基因列表)和经过良好研究的“基本途径网络”(KEGG途径)之间的系统比较,从而测量了途径和基因对基因集的重要性。该软件包对于研究人员找到生物标志物及其功能很有帮助。

作者:XC Zhang [AUT,CRE]

维护者:XC Zhang

引用(从r内,输入引用(“ PFP”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ pfp”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ PFP”)

html R脚本 途径指纹:基于基因表达数据和途径知识的生物标志物发现工具
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 1.4.0
在生物导体中 Bioc 3.13(R-4.1)(1年)
执照 GPL-2
要看 R(> = 4.0)
进口 图形,,,,Igraph,,,,kegggraph,,,,clusterProfiler,,,,GGPLOT2,,,,plyr,,,,花花公子,,,,马格里特,统计,方法,utils
链接
建议 尼特,,,,测试,,,,rmarkDown,,,,org.hs.eg.db
系统要求
增强
URL https://github.com/aib-group/pfp
BugReports https://github.com/aib-group/pfp/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 pfp_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 pfp_1.4.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) pfp_1.4.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pfp
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/pfp
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/pfp/
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