Bioconductor版本:发行版(3.16)
一个可复制和易于使用的工具包,用于组学数据集的可视化、预处理、探索和统计分析。poa的主要目的是在一个易于理解和用户友好的R包中实现灵活的数据清理和统计分析过程。这个包有一个闪亮的应用程序版本,叫做POMAShiny,它实现了所有的POMA函数。见https://github.com/pcastellanoescuder/POMAShiny。参见Castellano-Escuder P, González-Domínguez R, Carmona-Pontaque F等人(2021)
作者:Pol Castellano-Escuder [aut, cre]
维护者:Pol Castellano-Escuder
引用(从R中,输入引用(“POMA”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" poa ")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:
browseVignettes(“POMA”)
超文本标记语言 | R脚本 | POMA EDA示例 |
超文本标记语言 | R脚本 | POMA归一化方法 |
超文本标记语言 | R脚本 | POMA工作流 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor公司 | BioC 3.12 (R-4.0)(2年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 4.0) |
进口 | 扫帚,脱字符号,ComplexHeatmap,dbscan,dplyr,DESeq2,ggplot2,ggrepel,glasso(> = 1.11),glmnet,嫁祸于,limma,magrittr,mixOmics,randomForest,RankProd(> = 3.14),rmarkdown,SummarizedExperiment,宠物猫,tidyr,uwot,素食主义者 |
链接 | |
建议 | BiocStyle,covr,ggraph,knitr,拼接而成,情节,tidyverse,testthat2.3.2 (> =) |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/pcastellanoescuder/POMA |
BugReports | https://github.com/pcastellanoescuder/POMA/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | fobitools |
给我的链接 | |
构建报告 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | POMA_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | POMA_1.8.0.zip |
macOS二进制文件(x86_64) | POMA_1.8.0.tgz |
macOS二进制文件(arm64) | POMA_1.7.19.tgz |
源库 | git clone https://git.bioconductor.org/packages/POMA |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ poa |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/POMA/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |
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